腹腔镜与内视镜主要接触的是粘膜组织所产生的有机污染,而不是以血液为主的有机污染,被污染有机成分的标的物与手术器械以血液为主要污染是不一样的。腹腔镜与内视镜所接触的粘膜分泌粘液，其主要成分为粘糖蛋白、糖蛋白、类脂、无机盐(维持生物体内的酸碱平衡)、水等。粘糖蛋白可使粘液具有胶状、凝聚和粘合等特性。糖蛋白参与的生理功能包括凝血、免疫、分泌、内吞、物质转运、信息传递、神经传导、生长及分化的调节、细胞迁移、细胞归巢、创伤修复及再生等。糖蛋白亦具有特定的理化性质（如润滑性、粘弹性、抗热失活、抗蛋白酶水解及抗冻性等）。
消化道上皮细胞分泌的粘液主要部份是糖蛋白，如颌下腺黏蛋白、胃粘蛋白，且难溶于水。消化道粘液糖蛋白、呼吸道粘液糖蛋白、泌尿生殖系统粘液糖蛋白，这些糖蛋白一方面具有润滑作用，另一方面，又具有保护粘膜的作用，消化道粘膜分泌多种糖蛋白，有抑制胃液中胃蛋白酶的作用。
所有的蛋白成分，可使用强酸或者强碱的化学因素，可以使蛋白质类产生变性，而溶解于水中，这也是最为快速有效地分解办法。
很多人批评，强碱与强酸的产品对护理人员身体有很强的危害性，所以应该选择中性的多酶类产品才安全。这样的说法，从酸碱与中性的对比来说，我认为这个说法并没有错，从安全性角度来说，却并不一定完全的正确。
但从医疗清洗确效的角度上来看，对于腹腔及内视镜所污染的粘膜粘液及类脂与无机盐的去除，多酶类产品清洗剂可能几乎不具有太多的效去除的效果，特别是PH值为中性的清洗产品，对腹腔及内视镜有机物质的去除效果微乎其微。从安全性角度来说，医疗生产制造与化工生产制造在原料的选择性上面，医疗生产制造的碱性清洗剂的安全性，会远远高于化工生产制造的碱性清洗剂，其根本的原因在于在能达到相同功能的原料上，医疗生产制造的原料所要求的是必须对人体安全性考虑为选择的首要，这是化工生产制造远不能及的。
举例来说，柠檬汁原液的PH值约为2-3之间，我门都清楚，柠檬汁接触皮肤表面并不会造成皮肤表面任何的伤害，但是有许多PH值2-3之间的成分物质，接触皮肤后确会造成皮肤严重的灼伤与溃烂。所以、PH值的高与低，并不是唯一判断操作是否安全的唯一依据。
其他在粘膜上附着的有机物的去除，碱性清洗剂产品在与去除其余有机物的成分，与酸性清洗剂比较，在化学反应上会显得相对有效，所以这就是为何碱性清洗剂去除粘膜粘液的效果会优于酸性清洗剂的使用效果。
也因如此，在欧洲对医疗操作安全要求如此高的地方，仍是选择医疗生产制造的碱性清洗剂作为内视镜与腹腔镜清洗的首选。
